RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 ARSAP15289 507 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 GMPRP36959 345 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 GP5P40197 560 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 MPP1Q00013 466 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 GPR149Q86SP6 731 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SRLQ86TD4 932 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ACDQ96AP0 544 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ASB16Q96NS5 453 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 RANBP9Q96S59 729 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 CPNE1Q99829 537 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SLC17A7Q9P2U7 560 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SZT2Q5T011 3432 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 AURKAO14965 403 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 LDB2O43679 373 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 BNIP3LO60238 219 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 PIGNO95427 931 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 PAPLNO95428 1278 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 CYP17A1P05093 508 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ITGA2BP08514 1039 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SLC8A1P32418 973 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ARSDP51689 593 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 PLK1P53350 603 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 CTBP1Q13363 440 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 DHCR24Q15392 516 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 TCP10LQ8TDR4 215 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 DENND1AQ8TEH3 1009 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 CENPTQ96BT3 561 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 OR51F1A6NGY5 319 aa22.24■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 EPOP01588 193 aa22.24■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SRCP12931 536 aa22.24■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.24■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.24■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ACVR1CQ8NER5 493 aa22.24■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.24■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 RBBP8Q99708 897 aa22.24■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.24■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 MROH6A6NGR9 719 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 TPP1O14773 563 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SLC18A2Q05940 514 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SLC14A2Q15849 920 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 C12orf40Q86WS4 652 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 EFHBQ8N7U6 833 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 OR13C4Q8NGS5 318 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SMARCD2Q92925 531 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 MTBPQ96DY7 904 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 APOPT1Q96IL0 206 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 EPN3Q9H201 632 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ERICH4A6NGS2 130 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 EML3Q32P44 896 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 GRTP1Q5TC63 336 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 TMEM215Q68D42 235 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 EBF3Q9H4W6 596 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 PAMP19021 973 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 CES1P23141 567 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 GABRB3P28472 473 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ABL2P42684 1182 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SLC1A2P43004 574 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 NEK3P51956 506 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 PGGT1BP53609 377 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SLC12A1Q13621 1099 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 GEN1Q17RS7 908 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 DCLK2Q8N568 766 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 HDAC10Q969S8 669 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 OTUB2Q96DC9 234 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 MARK1Q9P0L2 795 aa22.22■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms