RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 IL2RBP14784 551 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SLC16A2P36021 539 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ABCG1P45844 678 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TROAPQ12815 778 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 PKN1Q16512 942 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SLFN13Q68D06 897 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MARK4Q96L34 752 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L5A8MUK1 530 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 C2orf74A8MZ97 194 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 H3BMQ9 156 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 KLRC4O43908 158 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 PGRP06401 933 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MED22Q15528 200 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MEIOBQ8N635 442 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 URGCPQ8TCY9 931 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 COG8Q96MW5 612 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC32Q9BV29 185 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 INVSQ9Y283 1065 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 KDM4BO94953 1096 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CLCA4Q14CN2 919 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 LIN54Q6MZP7 749 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.375e-7■■■□□ 19.1
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SBNO1-202ENST00000420886 H0YAE9 185 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TNNI3P19429 210 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SFNP31947 248 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CUL2Q13617 745 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 LRRC38Q5VT99 294 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CREB1P16220 341 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MAPK1P28482 360 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CYP4F2P78329 520 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CYP4F3Q08477 520 aa6.5□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 RNF112Q9ULX5 631 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 UPK1BO75841 260 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MARCKSL1P49006 195 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CDC42P60953 191 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 KCNMB4Q86W47 210 aa6.5□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.5□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 ALG2Q9H553 416 aa6.5□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.5□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 PTPRMP28827 1452 aa6.5□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 PRKCEQ02156 737 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 STILQ15468 1287 aa6.49□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SERPINB7O75635 380 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 BTDP43251 543 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 PIK3CGP48736 1102 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CDH15P55291 814 aa6.49□□□□□ -1.37
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