RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ITIH6Q6UXX5 1313 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A1W2PRG0 241 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LINC01553A4QN01 128 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RRN3P2A6NIE6 340 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AQP12BA6NM10 295 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A6NNZ2 444 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ERVV-2B6SEH9 535 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRSS44E7EML9 344 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 F8W8V4 182 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLCO1B7G3V0H7 640 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 H0YIN7 160 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 WNT10BO00744 389 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AP3D1O14617 1153 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 STX16O14662 325 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PSMA7O14818 248 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MGST3O14880 152 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SCAMP1O15126 338 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SPINT2O43291 252 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZBTB43O43298 467 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRT86O43790 486 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CREB3O43889 395 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SH3BP5O60239 455 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FGF17O60258 216 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NBNO60934 754 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZBED4O75132 1171 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TNFRSF6BO95407 300 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 VNN2O95498 520 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DDX58O95786 925 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DDAH2O95865 285 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SCGB1D1O95968 90 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LCATP04180 440 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 H1F0P07305 194 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NGFRP08138 427 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RFPL3SP0C7P2 107 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLA2G4BP0C869 781 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC5A1P13866 664 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CHRNB2P17787 502 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRT4P19013 534 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KCNA5P22460 613 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRPH2P23942 346 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KLRK1P26718 216 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TYK2P29597 1187 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HOXC9P31274 260 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TNFSF8P32971 234 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HTR7P34969 479 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BSGP35613 385 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CPOXP36551 454 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMPOP42166 694 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FASLGP48023 281 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SOX2P48431 317 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FMO5P49326 533 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GNAQP50148 359 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF84P51523 738 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARSFP54793 590 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 P2RX3P56373 397 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP10-8P60410 259 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SHC2P98077 582 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZXDBP98169 803 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EFNB1P98172 346 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PDE1BQ01064 536 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DEUP1Q05D60 604 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM27E3Q08E93 113 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLA2G7Q13093 441 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MTAPQ13126 283 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SNTA1Q13424 505 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OLIG2Q13516 323 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ACVR2BQ13705 512 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRT81Q14533 505 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RPE65Q16518 533 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KIF19Q2TAC6 998 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AP5B1Q2VPB7 878 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FGD3Q5JSP0 725 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 WDR45BQ5MNZ6 344 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ENTPD8Q5MY95 495 aa0.89□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms