RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, human

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX4-216	ENST00000566353	GCAT	O75600	419 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	TM7SF2	O76062	418 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	IGSF6	O95976	241 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	KRT3	P12035	628 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	YPEL5	P62699	121 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	C1orf61	Q13536	156 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	PERM1	Q5SV97	790 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	MACC1	Q6ZN28	852 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	TTC7B	Q86TV6	843 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	GLMN	Q92990	594 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	EPAS1	Q99814	870 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	VPS16	Q9H269	839 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	ATM	Q13315	3056 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	MUSK	O15146	869 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	GPD1	P21695	349 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	RPIA	P49247	311 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	RHOA	P61586	193 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	RAD51	Q06609	339 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	ZNF843	Q8N446	348 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	KLC2	Q9H0B6	622 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		21.31	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	LRP4	O75096	1905 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	LMO7DN	F2Z398	122 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	TOR1B	O14657	336 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	KLK10	O43240	276 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	TCEA3	O75764	348 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	ANXA6	P08133	673 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	ITIH2	P19823	946 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	EPHB2	P29323	1055 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	KRT31	Q15323	416 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	EFHC2	Q5JST6	749 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	FAXC	Q5TGI0	409 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	NETO2	Q8NC67	525 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	NAT6	Q93015	286 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	DPH1	Q9BZG8	443 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	DKK3	Q9UBP4	350 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		21.3	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	RP1	P56715	2156 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	CCP110	O43303	1012 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	TIMP2	P16035	220 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	STAT1	P42224	750 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	RHD	Q02161	417 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	PPARD	Q03181	441 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	CFHR1	Q03591	330 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	IRF4	Q15306	451 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	WDR59	Q6PJI9	974 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	C3orf20	Q8ND61	904 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	HMCES	Q96FZ2	354 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	CLPB	Q9H078	707 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		21.29	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
STX4-216	ENST00000566353	YY2	O15391	372 aa		21.28	■■□□□ 1

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