RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

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Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 CCL22O00626 93 aa22.3■■□□□ 1.16
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VSX1-205ENST00000429762 TYRP14679 529 aa22.3■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 ADRA1DP25100 572 aa22.3■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 SEC24CP53992 1094 aa22.3■■□□□ 1.16
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VSX1-205ENST00000429762 CNGA3Q16281 694 aa22.3■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.3■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 MYLIPQ8WY64 445 aa22.3■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.3■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 TRIB3Q96RU7 358 aa22.3■■□□□ 1.16
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VSX1-205ENST00000429762 FSHRP23945 695 aa22.29■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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VSX1-205ENST00000429762 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa22.29■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.29■■□□□ 1.16
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VSX1-205ENST00000429762 TRAF2Q12933 501 aa22.29■■□□□ 1.16
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VSX1-205ENST00000429762 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.28■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 CA4P22748 312 aa22.28■■□□□ 1.16
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VSX1-205ENST00000429762 GKP32189 559 aa22.28■■□□□ 1.16
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VSX1-205ENST00000429762 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 RETSATQ6NUM9 610 aa22.28■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 STRA8Q7Z7C7 330 aa22.28■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.28■■□□□ 1.16
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VSX1-205ENST00000429762 FGF13Q92913 245 aa22.28■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 ASIC4Q96FT7 647 aa22.28■■□□□ 1.16
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VSX1-205ENST00000429762 TREX1Q9NSU2 369 aa22.28■■□□□ 1.16
VSX1-205ENST00000429762 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa22.28■■□□□ 1.16
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VSX1-205ENST00000429762 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
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VSX1-205ENST00000429762 LGSNQ5TDP6 509 aa22.26■■□□□ 1.15
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VSX1-205ENST00000429762 SH2D5Q6ZV89 423 aa22.26■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.26■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 BANPQ8N9N5 519 aa22.26■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 FAM107BQ9H098 131 aa22.26■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 A0A0U1RQS6 177 aa22.25■■□□□ 1.15
VSX1-205ENST00000429762 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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