RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF139	Q8WU17	664 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	EXT2	Q93063	718 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	RTP4	Q96DX8	246 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	VPS39	Q96JC1	886 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	IFT52	Q9Y366	437 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM233	B4DJY2	109 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	PPEF2	O14830	753 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ESRRG	P62508	458 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF460	Q14592	562 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	GK5	Q6ZS86	529 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CHST13	Q8NET6	341 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	RBBP8	Q99708	897 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	FZD8	Q9H461	694 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ASB7	Q9H672	318 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57	1e-6	■□□□□ 11.3
SSUH2-208	ENST00000455157	NME5	P56597	212 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	TPI1	P60174	286 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	MS4A2	Q01362	244 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CTBS	Q01459	385 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ADIG	Q0VDE8	80 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	KCTD2	Q14681	263 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	INSC	Q1MX18	579 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	HPS1	Q92902	700 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	THAP11	Q96EK4	314 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CIB1	Q99828	191 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	PSD2	Q9BQI7	771 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CHST12	Q9NRB3	414 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	KLK14	Q9P0G3	267 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	HBP1	O60381	514 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	VAPB	O95292	243 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	GSR	P00390	522 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ICAM3	P32942	547 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CDKL1	Q00532	357 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CEACAM7	Q14002	265 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	AGK	Q53H12	422 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	XKR5	Q6UX68	686 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	VPS45	Q9NRW7	570 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	SNTG2	Q9NY99	539 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	MLN	P12872	115 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	LIMK2	P53671	638 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	POU6F1	Q14863	301 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ELMOD1	Q8N336	334 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF786	Q8N393	782 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	REPS2	Q8NFH8	660 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CALML6	Q8TD86	181 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	MED30	Q96HR3	178 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	GPR20	Q99678	358 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	XPR1	Q9UBH6	696 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	AP4S1	Q9Y587	144 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		11.48	□□□□□ -0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms