RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLCA2Q9UQC9 943 aa26.58■■□□□ 1.85
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A087WV48 116 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMCC1O94876 653 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC172P0C7W6 258 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GIMD1P0DJR0 217 aa26.57■■□□□ 1.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AIF1P55008 147 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTP5Q14D33 572 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa26.56■■□□□ 1.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCUN1D2Q6PH85 259 aa26.56■■□□□ 1.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DENND6BQ8NEG7 585 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTYH3Q9C0H2 523 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGSF10Q6WRI0 2623 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3BM21 787 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPINT1O43278 529 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGSF6O95976 241 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSF2P04141 144 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DESP17661 470 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHOAP61586 193 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARP15Q460N3 678 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC7BQ86TV6 843 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCOLN2Q8IZK6 566 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AOPEPQ8N6M6 819 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa26.55■■□□□ 1.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASA4BC9J798 803 aa26.54■■□□□ 1.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASA4O43374 803 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP1A3P13637 1013 aa26.54■■□□□ 1.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAP1Q92560 729 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 K7ESM1 405 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEBLO76041 1014 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBD3O95983 291 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MT-CO3P00414 261 aa26.53■■□□□ 1.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC73Q5JTD7 316 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM181AQ8N9Y4 354 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NETO2Q8NC67 525 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP29Q9HBJ7 922 aa26.53■■□□□ 1.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa26.53■■□□□ 1.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PFN3P60673 137 aa26.52■■□□□ 1.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM7AQ6ZMT4 941 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VCPIP1Q96JH7 1222 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO6Q9UM54 1294 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OPA1O60313 960 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYF5P13349 255 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HTR7P34969 479 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OGDHQ02218 1023 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPRG1LQ5T0D9 272 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS36Q86VN1 386 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXorf40AQ8TE69 158 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CENPTQ96BT3 561 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DONSONQ9NYP3 566 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAS2R14Q9NYV8 317 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DKK3Q9UBP4 350 aa26.51■■□□□ 1.83
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