RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 GRK6P43250 576 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 MXI1P50539 228 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 TUBA1BP68363 451 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 BNC1Q01954 994 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 HYAL1Q12794 435 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC18A3Q16572 532 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 DCAF6Q58WW2 860 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9orf57Q5W0N0 161 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 RETSATQ6NUM9 610 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 MON1AQ86VX9 555 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 C2CD5Q86YS7 1000 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 STAMQ92783 540 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 SH3KBP1Q96B97 665 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBC1D20Q96BZ9 403 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 COG8Q96MW5 612 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUX5Q96PT3 197 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 YME1L1Q96TA2 773 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 MSTO1Q9BUK6 570 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 GDAQ9Y2T3 454 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 COMMD10Q9Y6G5 202 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 DYTNA2CJ06 578 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 PEX12O00623 359 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 NBNO60934 754 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 LDB3O75112 727 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CH25HO95992 272 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYF6P23409 242 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 PEX5P50542 639 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 HDAC4P56524 1084 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERVFC1-1P60608 527 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADORA2A-AS1P86434 159 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC18A2Q05940 514 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 DDR1Q08345 913 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM27E3Q08E93 113 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD1Q15327 319 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 EDRF1Q3B7T1 1238 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CES5AQ6NT32 575 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPATA5Q8NB90 893 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZMIZ2Q8NF64 920 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIB2Q92519 343 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM63Q969Q1 353 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGSF21Q96ID5 467 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARPC5LQ9BPX5 153 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL25Q9H293 177 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC32A1Q9H598 525 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGAP10A1A4S6 786 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 TIMM23O14925 209 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLK10O43240 276 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP2C2O75185 946 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF432O94892 652 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 VNN2O95498 520 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHRM4P08173 479 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CENPAP49450 140 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARL4CP56559 192 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ST3GAL1Q11201 340 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 RUNX2Q13950 521 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAA25Q14CX7 972 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 XKR9Q5GH70 373 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9orf50Q5SZB4 431 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 NEK10Q6ZWH5 1172 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CUZD1Q86UP6 607 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPXM2Q8N436 756 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 MTBPQ96DY7 904 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADGRG7Q96K78 797 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLITRK1Q96PX8 696 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD180Q99467 661 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTPRHQ9HD43 1115 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ALKBH4Q9NXW9 302 aa3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms