RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 KDM4CQ9H3R0 1056 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 EBF2Q9HAK2 575 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 SP110Q9HB58 689 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 CAPN10Q9HC96 672 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 FSCN3Q9NQT6 498 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 LRRD1A4D1F6 860 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 BTNL10A8MVZ5 291 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 INSIG1O15503 277 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 SPOPO43791 374 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 MFSD11O43934 449 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 MAFKO60675 156 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 PALMO75781 387 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 IGSF6O95976 241 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 CFIP05156 583 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 SERPINF2P08697 491 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 ITGB7P26010 798 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 SERPINB6P35237 376 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 RGRP47804 291 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 VAV2P52735 878 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 PPP2CBP62714 309 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 PPP2CAP67775 309 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 ARHGAP8P85298 464 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 RHOT1Q8IXI2 618 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TPCN2Q8NHX9 752 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 PPP1R16AQ96I34 528 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 LRIG1Q96JA1 1093 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 EXOC2Q96KP1 924 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 RNF157Q96PX1 679 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 SUSD2Q9UGT4 822 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 GON4LQ3T8J9 2241 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 A0A0U1RQJ8 604 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 A0A1B0GTW7 788 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 ZNF487B1APH4 448 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 MUSKO15146 869 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 PJA2O43164 708 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 UGT2B4P06133 528 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TNNT1P13805 278 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 GNSP15586 552 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 CD27P26842 260 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 CCR5P51681 352 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 GSDMDP57764 484 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 C11orf63Q6NUN7 778 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 RABEPKQ7Z6M1 372 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 VSIG1Q86XK7 387 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 RMDN1Q96DB5 314 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 ZNF599Q96NL3 588 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 DESI2Q9BSY9 194 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 EDEM2Q9BV94 578 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 DYRK4Q9NR20 520 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 A0A1W2PPC4 97 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 LATO43561 262 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 MAP3K6O95382 1288 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 KRT1P04264 644 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 ADRB3P13945 408 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 ENGP17813 658 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 NEK3P51956 506 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 GBE1Q04446 702 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 GALNT2Q10471 571 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 TMCO4Q5TGY1 634 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 LRRC49Q8IUZ0 686 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 PLD5Q8N7P1 536 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 NETO1Q8TDF5 533 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-206ENST00000443528 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
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