RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556355.5

SRP54-AS1-203, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 603 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CNTN5O94779 1100 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TGM2P21980 687 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MAPK4P31152 587 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ACTN2P35609 894 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MTNR1AP48039 350 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ADPRHP54922 357 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MC1RQ01726 317 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CREB5Q02930 508 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GAB1Q13480 694 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ACVR2BQ13705 512 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IL13RA2Q14627 380 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KCNB1Q14721 858 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC18A3Q16572 532 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 AP5B1Q2VPB7 878 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MTX3Q5HYI7 312 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM65Q6PI78 240 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C1QL2Q7Z5L3 287 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CNTROBQ8N137 903 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TTC39CQ8N584 583 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TERB1Q8NA31 727 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C11orf65Q8NCR3 313 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SCFD2Q8WU76 684 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 POMGNT1Q8WZA1 660 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HSPH1Q92598 858 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SMARCE1Q969G3 411 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KLHL29Q96CT2 875 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KAZALD1Q96I82 304 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MAFFQ9ULX9 164 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DHDHQ9UQ10 334 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PKP3Q9Y446 797 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.71□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BTBD19C9JJ37 291 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SMIM22K7EJ46 135 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PRYO14603 147 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 VILLO15195 856 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GCATO75600 419 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 JTBO76095 146 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MLYCDO95822 493 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PRR35P0CG20 571 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 AKR1B1P15121 316 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PORP16435 677 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RRM1P23921 792 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CPOXP36551 454 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RGS2P41220 211 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF84P51523 738 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CRYMQ14894 314 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM81Q6P7N7 255 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CYP20A1Q6UW02 462 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TAGAPQ8N103 731 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GHDCQ8N2G8 530 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ATP2A3Q93084 1043 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CALML4Q96GE6 196 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FEM1CQ96JP0 617 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CENPOQ9BU64 300 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PEMTQ9UBM1 199 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DTX4Q9Y2E6 619 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SNX8Q9Y5X2 465 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KCNE2Q9Y6J6 123 aa4.7□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR6C68A6NDL8 312 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CEP104O60308 925 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CSH1P0DML2 217 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CSH2P0DML3 217 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MPGP29372 298 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PSMB10P40306 273 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PRAMEP78395 509 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DMWDQ09019 674 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 EPS8Q12929 822 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GSTA3Q16772 222 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF425Q6IV72 752 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms