RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559974.5

RABGGTA-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,963 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-212ENST00000559974 MAGEA12P43365 314 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 OR1G1P47890 313 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 LIMK2P53671 638 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 IRX4P78413 519 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 STX3Q13277 289 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 C16orf46Q6P387 395 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 USP33Q8TEY7 942 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 MFSD3Q96ES6 412 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 SERPINB11Q96P15 392 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 THAP1Q9NVV9 213 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 UBP1Q9NZI7 540 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PTPN4P29074 926 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 SERPINB8P50452 374 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM189BP81408 668 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 DEFB103AP81534 67 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 ARTNQ5T4W7 220 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 MBLAC2Q68D91 279 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 KCNMB4Q86W47 210 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 DCLK2Q8N568 766 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 SEPT8Q92599 483 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 AGAP2Q99490 1192 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 SNX15Q9NRS6 342 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 COL4A6Q14031 1691 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 MAFKO60675 156 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 TPH1P17752 444 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 KRT72Q14CN4 511 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PCLAFQ15004 111 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PPM1JQ5JR12 505 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 NUP93Q8N1F7 819 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 FCRL5Q96RD9 977 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 IL12RB2Q99665 862 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 HCSTQ9UBK5 93 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 SCML2Q9UQR0 700 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 E9PAM4 449 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 MATN3O15232 486 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 WFS1O76024 890 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 ANXA9O76027 345 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PROCP04070 461 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PRKCGP05129 697 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 TUBP50607 506 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 MON1AQ86VX9 555 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 CEP57Q86XR8 500 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 TMEM199Q8N511 208 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 NSL1Q96IY1 281 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 C8orf48Q96LL4 319 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 WWP1Q9H0M0 922 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 TLE6Q9H808 572 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 GLOD4Q9HC38 313 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 IL23AQ9NPF7 189 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 OSER1Q9NX31 292 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 FCHO1O14526 889 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 TIMM44O43615 452 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 KITP10721 976 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 KCNA4P22459 653 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 NMBRP28336 390 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 AQP5P55064 265 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-212ENST00000559974 FPGSQ05932 587 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms