RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ACSL1	P33121	698 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ARL4A	P40617	200 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	HDAC4	P56524	1084 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	INAVA	Q3KP66	663 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PPM1J	Q5JR12	505 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZVU0	165 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC185	Q8N715	623 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PAF1	Q8N7H5	531 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO19	Q96H55	970 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	IL36A	Q9UHA7	158 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	DMD	P11532	3685 aa		11.58	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0D9SEW6	157 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO1F	O00160	1098 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	BUB1	O43683	1085 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	AKR1B10	O60218	316 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	DFNA5	O60443	496 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	SRC	P12931	536 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	MAOB	P27338	520 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRNA3	P32297	505 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	NUMB	P49757	651 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC14A1	Q13336	389 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	PARP15	Q460N3	678 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	BOLA3	Q53S33	107 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	ODF2	Q5BJF6	829 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP58	Q5T655	872 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	TRNP1	Q6NT89	227 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	TMIE	Q8NEW7	156 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	OR7D4	Q8NG98	312 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	MTG2	Q9H4K7	406 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	CD93	Q9NPY3	652 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	FZD10	Q9ULW2	581 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP54	Q96N23	3096 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BRJ5	948 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	NEMP1	O14524	444 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	SNAP91	O60641	907 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	IGSF6	O95976	241 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	C7	P10643	843 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	CEACAM1	P13688	526 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	CASP14	P31944	242 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	GRIA4	P48058	902 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	IRAK1	P51617	712 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	CCR5	P51681	352 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	GALC	P54803	685 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	CARD16	Q5EG05	197 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TTLL3-231	ENST00000496246	LINGO4	Q6UY18	593 aa		11.57	□□□□□ -0.56

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