RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	NUP205	Q92621	2012 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PP55	124 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	LNP1	A1A4G5	178 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	C4orf47	A7E2U8	309 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	MID1	O15344	667 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC7A4	O43246	635 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP9B	O43861	1147 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CREB3	O43889	395 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CNTN5	O94779	1100 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CER1	O95813	267 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	GOT1	P17174	413 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ENG	P17813	658 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	EPHB2	P29323	1055 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	L1CAM	P32004	1257 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	NUDT1	P36639	197 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	DNA2	P51530	1060 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	IRX4	P78413	519 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	GNA12	Q03113	381 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ACAP1	Q15027	740 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	STK40	Q8N2I9	435 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP44	Q9C0F1	390 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEH1	Q9H213	219 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CD248	Q9HCU0	757 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP33	O14559	1287 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	MCF2L	O15068	1137 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CCP110	O43303	1012 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	GDF9	O60383	454 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEC1	O60732	1142 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	LRIG2	O94898	1065 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SKIL	P12757	684 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	C21orf59	P57076	290 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TPI1	P60174	286 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SCAP	Q12770	1279 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PTP4A2	Q12974	167 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ALF	Q53S48	1182 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	BNIPL	Q7Z465	357 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPRN2	Q92932	1015 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TCEAL3	Q969E4	200 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ZWILCH	Q9H900	591 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAI1	Q9UI46	699 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	PATE3	B3GLJ2	98 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	GJB6	O95452	261 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TTLL3-231	ENST00000496246	CD27	P26842	260 aa		11.59	□□□□□ -0.55

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