RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 VAV1P15498 845 aa27.37■■□□□ 1.97
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ODC1-204ENST00000446285 OR14C36Q8NHC7 312 aa27.37■■□□□ 1.97
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ODC1-204ENST00000446285 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
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ODC1-204ENST00000446285 PPM1HQ9ULR3 514 aa27.36■■□□□ 1.97
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ODC1-204ENST00000446285 C21orf59P57076 290 aa27.35■■□□□ 1.97
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ODC1-204ENST00000446285 SLC45A4Q5BKX6 768 aa27.33■■□□□ 1.97
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ODC1-204ENST00000446285 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa27.32■■□□□ 1.96
ODC1-204ENST00000446285 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
ODC1-204ENST00000446285 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
ODC1-204ENST00000446285 C3orf20Q8ND61 904 aa27.32■■□□□ 1.96
ODC1-204ENST00000446285 PCDHB18PQ96TA0 734 aa27.32■■□□□ 1.96
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