RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 C7P10643 843 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CCND2P30279 289 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TTKP33981 857 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PPIL2Q13356 520 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 DUOXA2Q1HG44 320 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ZNF699Q32M78 642 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ZNF394Q53GI3 561 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 SPANXN3Q5MJ09 141 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 C6orf10Q5SRN2 563 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ZYG11AQ6WRX3 759 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 HACD2Q6Y1H2 254 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 GPR141Q7Z602 305 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CORO1BQ9BR76 489 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ADPGKQ9BRR6 497 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 EFCAB1Q9HAE3 211 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TBC1D23Q9NUY8 699 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PACSIN3Q9UKS6 424 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 COQ6Q9Y2Z9 468 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 AP4S1Q9Y587 144 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 FADS3Q9Y5Q0 445 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 HACD1B0YJ81 288 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 H3BMQ9 156 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 K7ERI5 159 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 FBP2O00757 339 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CILPO75339 1184 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 HSPA4LO95757 839 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 FUCA1P04066 466 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 GARSP41250 739 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 NAA20P61599 178 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PTK2BQ14289 1009 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 DPYSL2Q16555 572 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 SWSAP1Q6NVH7 229 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ZNF354CQ86Y25 554 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TNIP2Q8NFZ5 429 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 FAM151AQ8WW52 585 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 RXFP2Q8WXD0 754 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 COG8Q96MW5 612 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 SLC29A1Q99808 456 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 BRD8Q9H0E9 1235 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 DBNDD1Q9H9R9 158 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TMEM9Q9P0T7 183 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 DOCK1Q14185 1865 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TMEM247A6NEH6 219 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TARM1B6A8C7 271 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 MSCO60682 206 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 E2F6O75461 281 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ATE1O95260 518 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 APOA4P06727 396 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 P4HA1P13674 534 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 MPSTP25325 297 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 HOXD12P35452 270 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 RPL14P50914 215 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PKNOX1P55347 436 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 LRP8Q14114 963 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 C16orf72Q14CZ0 275 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CA9Q16790 459 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TREML2Q5T2D2 321 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 LSMEM2Q8N112 164 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 DCLK2Q8N568 766 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 HMGCLL1Q8TB92 370 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ATP6V1E2Q96A05 226 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PLEKHA8Q96JA3 519 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TWNKQ96RR1 684 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TMEM79Q9BSE2 394 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ELOVL4Q9GZR5 314 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 DNAI2Q9GZS0 605 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ZNF358Q9NW07 568 aa10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 HTR3EA5X5Y0 456 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 PRPSAP2O60256 369 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 PFKMP08237 780 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CYP3A5P20815 502 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CAPSQ13938 189 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 MOGQ16653 247 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 SEL1L3Q68CR1 1132 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 DEPTORQ8TB45 409 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 LRTOMTQ8WZ04 291 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms