RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.61■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 ASB3Q9Y575 518 aa22.61■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 RASA4BC9J798 803 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 RASA4O43374 803 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 TEX44Q53QW1 395 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 CNTD1Q8N815 330 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 CPQQ9Y646 472 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 PIAS1O75925 651 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 HDCP19113 662 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 CCNCP24863 283 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 MPP5Q8N3R9 675 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 CFAP36Q96G28 342 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 TSGA13Q96PP4 275 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 UBP1Q9NZI7 540 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 J3KR12 359 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 RASGRF2O14827 1237 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 LPXNO60711 386 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 CCNB1P14635 433 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 ELMOD1Q8N336 334 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 MCUQ8NE86 351 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 TTC25Q96NG3 672 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 GBA3Q9H227 469 aa22.59■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 MTSS1O43312 755 aa22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 OR1E1P30953 314 aa22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 ACVRL1P37023 503 aa22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 CCR2P41597 374 aa22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 TEKT5Q96M29 485 aa22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 TEX264Q9Y6I9 313 aa22.58■■□□□ 1.21
VSX1-205ENST00000429762 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.58■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 USP12O75317 370 aa22.58■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 NDST2P52849 883 aa22.58■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 UBE3AQ05086 875 aa22.58■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 PALM2Q8IXS6 379 aa22.58■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 OR52K2Q8NGK3 314 aa22.58■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.58■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 ASAH2Q9NR71 780 aa22.58■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 MATN3O15232 486 aa22.57■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 CKMP06732 381 aa22.57■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 ABHD2P08910 425 aa22.57■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 CRADDP78560 199 aa22.57■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 GPM6BQ13491 265 aa22.57■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 CCDC38Q502W7 563 aa22.57■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.57■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.57■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.57■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 RAMP2O60895 175 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 OLFM2O95897 454 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 HLA-DQB2P05538 268 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 APOL2Q9BQE5 337 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 C5orf22Q49AR2 442 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 FBF1Q8TES7 1133 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX1-205ENST00000429762 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms