RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NEK3P51956 506 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MLLT10P55197 1068 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CDH12P55289 794 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZP1P60852 638 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GPC5P78333 572 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RPP30P78346 268 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRAMEP78395 509 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KCNJ10P78508 379 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARF1P84077 181 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZBED6P86452 979 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PPATQ06203 517 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GRIK2Q13002 908 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GAGE1Q13065 139 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GAGE4Q13068 117 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MAPK7Q13164 816 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DNASE1L3Q13609 305 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CAMK1Q14012 370 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EFR3AQ14156 821 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTK2BQ14289 1009 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PPP2R5BQ15173 497 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PFKFB4Q16877 469 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TIGD6Q17RP2 521 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AAK1Q2M2I8 961 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ALFQ53S48 1182 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C10orf25Q5T742 122 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FNDC7Q5VTL7 733 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF626Q68DY1 528 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGFL4Q6B9Z1 124 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FCRL6Q6DN72 434 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HMBOX1Q6NT76 420 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TTI2Q6NXR4 508 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DENND1BQ6P3S1 775 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GGT6Q6P531 493 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AAGABQ6PD74 315 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PARM1Q6UWI2 310 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C4orf50Q6ZRC1 276 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MON1BQ7L1V2 547 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF627Q7L945 461 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SESTD1Q86VW0 696 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CHD1LQ86WJ1 897 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CHSY1Q86X52 802 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF280BQ86YH2 543 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARMC8Q8IUR7 673 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DENND6AQ8IWF6 608 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LAS2Q8IYD9 372 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HACE1Q8IYU2 909 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MMP21Q8N119 569 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ATG16L2Q8NAA4 619 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C9orf106Q8NAJ2 232 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C8orf58Q8NAV2 365 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR52N4Q8NGI2 321 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR1N1Q8NGS0 311 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CEP70Q8NHQ1 597 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RFWD2Q8NHY2 731 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SUN3Q8TAQ9 357 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM163Q8TC26 289 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PARD3BQ8TEW8 1205 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM216AQ8WUB2 273 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 POF1BQ8WVV4 589 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAR1Q8WVX9 515 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MAML1Q92585 1016 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SGCDQ92629 289 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MAP4K1Q92918 833 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC25A28Q96A46 364 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM149B1Q96BN6 582 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RTP4Q96DX8 246 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TXNDC15Q96J42 360 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LYZL4Q96KX0 146 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SGCZQ96LD1 299 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF570Q96NI8 536 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FRG2BQ96QU4 278 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SIGLEC11Q96RL6 698 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SIN3AQ96ST3 1273 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AGAP2Q99490 1192 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NEU1Q99519 415 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SH3GL2Q99962 352 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KXD1Q9BQD3 176 aa0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms