RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	CPA1	P15085	419 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CNTF	P26441	200 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	ABCG1	P45844	678 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	PGM5	Q15124	567 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CUL5	Q93034	780 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334		E5RJQ4	531 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	SYN3	O14994	580 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CTSA	P10619	480 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	GSTM2	P28161	218 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	AVPR2	P30518	371 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	ID2	Q02363	134 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	EFR3A	Q14156	821 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334		Q4G0T1	1027 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	POLB	P06746	335 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CYP4B1	P13584	511 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CIITA	P33076	1130 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	OAZ1	P54368	228 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	GALNT3	Q14435	633 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	STAM	Q92783	540 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	KAT2A	Q92830	837 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334		F8W810	466 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	NCAM2	O15394	837 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	ANP32C	O43423	234 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	TLR2	O60603	784 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	PYGL	P06737	847 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	ARSA	P15289	507 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	TYK2	P29597	1187 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	RHAG	Q02094	409 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	UBE3A	Q05086	875 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66

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