RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF398Q8TD17 642 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 C2CD4CQ8TF44 421 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RNF125Q96EQ8 232 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ASB2Q96Q27 587 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 FCRL5Q96RD9 977 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 AGAP2Q99490 1192 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TM2D2Q9BX73 214 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 MROH8Q9H579 483 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ERVK-5Q9HDB9 667 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SMC4Q9NTJ3 1288 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 AOX1Q06278 1338 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 C17orf100A8MU93 164 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TULP3O75386 442 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RNF8O76064 485 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 IGLV2-14P01704 120 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 AKR1A1P14550 325 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PRKCHP24723 683 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 GSTM2P28161 218 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ABCD3P28288 659 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TACR3P29371 465 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TYK2P29597 1187 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 HNF1BP35680 557 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 GPD2P43304 727 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 OAZ1P54368 228 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 CASP6P55212 293 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TUBA4AP68366 448 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RPP30P78346 268 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGAP8P85298 464 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TFF2Q03403 129 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 NFIL3Q16649 462 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SH2D4BQ5SQS7 431 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 HYIQ5T013 277 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 DSTYKQ6XUX3 929 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RNF144BQ7Z419 303 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 BRSK2Q8IWQ3 736 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 UEVLDQ8IX04 471 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RFFLQ8WZ73 363 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PIGKQ92643 395 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SH3KBP1Q96B97 665 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ELP4Q96EB1 424 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 APOPT1Q96IL0 206 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 EFHD1Q9BUP0 239 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 MLXIPLQ9NP71 852 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ARL15Q9NXU5 204 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 HDAC6Q9UBN7 1215 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 DTX4Q9Y2E6 619 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 KAT6AQ92794 2004 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 LRRC3CA6NJW4 275 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 LINC01548A6NM66 108 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 KCNJ18B7U540 433 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 INPPL1O15357 1258 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 BAIAP3O94812 1187 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 F9P00740 461 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PLAUP00749 431 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 FSHBP01225 129 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ST6GAL1P15907 406 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 CAPN3P20807 821 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RPS6KB1P23443 525 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 GGT5P36269 586 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 GJC1P36383 396 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 MTNR1AP48039 350 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PROK1P58294 105 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 YPEL5P62699 121 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RHAGQ02094 409 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB16Q05516 673 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 MTA1Q13330 715 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TDGQ13569 410 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 CAMK1Q14012 370 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM119Q4V9L6 283 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 GJB7Q6PEY0 223 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.1 ms