RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 MYBPHLA2RUH7 354 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 TPST1O60507 370 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 DAB1O75553 588 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 TOMM70O94826 608 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 PIGNO95427 931 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 OR4Q2P0C623 313 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 SLC2A3P11169 496 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 TSHRP16473 764 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CHRM3P20309 590 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 HADHAP40939 763 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 NPY2RP49146 381 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 HDAC4P56524 1084 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 USP4Q13107 963 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 VEPH1Q14D04 833 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 TDRPQ86YL5 185 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 BCO2Q9BYV7 579 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 PNPOQ9NVS9 261 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 DTLQ9NZJ0 730 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 MDM4O15151 490 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CSH1P0DML2 217 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CSH2P0DML3 217 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 SCNN1BP51168 640 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CLCNKBP51801 687 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 MAPRE2Q15555 327 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 FAM13CQ8NE31 585 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 EME1Q96AY2 570 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 SNX15Q9NRS6 342 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 RRN3Q9NYV6 651 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 V9GYQ6 96 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 MAGEB16A2A368 324 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 DDHD2O94830 711 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 STBD1O95210 358 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 THRAP10827 490 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CCNB1P14635 433 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 IVDP26440 423 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF132P52740 706 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 PLIN5Q00G26 463 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CCL14Q16627 93 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CCDC153Q494R4 210 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 TMC7Q7Z402 723 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 TTC7BQ86TV6 843 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 LRRC43Q8N309 656 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 GIPC2Q8TF65 315 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 FGD4Q96M96 766 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 DERAQ9Y315 318 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 F5H5T6 163 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 PRRG1O14668 218 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 ARHGAP8P85298 464 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 SREBF2Q12772 1141 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 AZIN2Q96A70 460 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 MFSD3Q96ES6 412 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 NDNQ99608 321 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 BAG5Q9UL15 447 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CDH9Q9ULB4 789 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 CLUHO75153 1309 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 YJEFN3A6XGL0 299 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 E7ENQ6 273 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 MPOP05164 745 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 BPGMP07738 259 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 OR1E1P30953 314 aa8.62□□□□□ -1.03
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