RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

BASIC

Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.2■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 PDE3BQ13370 1112 aa19.19■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 NASPP49321 788 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 CNTROBQ8N137 903 aa19.18■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 CCDC175P0C221 793 aa19.18■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 DDX19BQ9UMR2 479 aa19.18■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.17■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 JMYQ8N9B5 988 aa19.17■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 ZNF76P36508 570 aa19.16■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa19.15■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 SOGA3Q5TF21 947 aa19.15■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 SCLT1Q96NL6 688 aa19.15■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 PPP4R3AQ6IN85 833 aa19.14■□□□□ 0.66
NFIC-211ENST00000641145 FERP16591 822 aa19.14■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 EEA1Q15075 1411 aa19.14■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 CCDC113Q9H0I3 377 aa19.14■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.14■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 PDCP20941 246 aa19.13■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 NLRP13Q86W25 1043 aa19.13■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 CCDC150Q8NCX0 1101 aa19.13■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 E9PSI1 815 aa19.13■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 CHMP4BP1P59074 171 aa19.13■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 KIAA1328Q86T90 577 aa19.13■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 NUP155O75694 1391 aa19.13■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 TAF4BQ92750 862 aa19.12■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 HOOK3Q86VS8 718 aa19.12■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 TRIM22Q8IYM9 498 aa19.12■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 ATF3P18847 181 aa19.11■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.11■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 FSD1Q9BTV5 496 aa19.11■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 STK38Q15208 465 aa19.11■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 FAM177BA6PVY3 158 aa19.11■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP19.11■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP19.1■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 19.2
NFIC-211ENST00000641145 UBE4AQ14139 1066 aa19.1■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 SPC24Q8NBT2 197 aa19.1■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 TNIP1Q15025 636 aa19.1■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 TTC39AQ5SRH9 613 aa19.1■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 EVC2Q86UK5 1308 aa19.1■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 HIP1O00291 1037 aa19.1■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 CCDC69A6NI79 296 aa19.1■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 TSPYL4Q9UJ04 414 aa19.09■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 TICAM2Q86XR7 235 aa19.09■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa19.09■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 CBX1P83916 185 aa19.09■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.09■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 KIF15Q9NS87 1388 aa19.09■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 CNNM1Q9NRU3 951 aa19.09■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 UACAQ9BZF9 1416 aa19.08■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 TSPY26PQ9H489 355 aa19.08■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.08■□□□□ 0.65
NFIC-211ENST00000641145 NFKBIBQ15653 356 aa19.08■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 RNF214Q8ND24 703 aa19.08■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 CBFA2T2O43439 604 aa19.08■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 CCDC102AQ96A19 550 aa19.08■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 CCDC57Q2TAC2 916 aa19.07■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 TIGD1Q96MW7 591 aa19.07■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 MYZAPP0CAP1 466 aa19.07■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 GOPCQ9HD26 462 aa19.07■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.06■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 PDE4AP27815 886 aa19.06■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 PLCD3Q8N3E9 789 aa19.06■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.06■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 NACAP1Q9BZK3 213 aa19.06■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 CCDC148Q8NFR7 591 aa19.05■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 TSNARE1Q96NA8 513 aa19.05■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa19.05■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.05■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.05■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 COG6Q9Y2V7 657 aa19.05■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 CCDC158Q5M9N0 1113 aa19.04■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 FERMT2Q96AC1 680 aa19.04■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 SHTN1A0MZ66 631 aa19.04■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 CTNNA2P26232 953 aa19.03■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 RGS22Q8NE09 1264 aa19.03■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 CA8P35219 290 aa19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms