RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 KRT32Q14532 448 aa7.54□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 VPS36Q86VN1 386 aa7.54□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa7.54□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.54□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.54□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.54□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 TUBBP07437 444 aa7.54□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 FYB1O15117 783 aa7.54□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.54□□□□□ -1.2
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SCN2A-209ENST00000636071 TRIM5Q9C035 493 aa7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.53□□□□□ -1.2
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SCN2A-209ENST00000636071 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 SETSIPP0DME0 302 aa7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 CTR9Q6PD62 1173 aa7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 APBB1O00213 710 aa7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 RILPL2Q969X0 211 aa7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.53□□□□□ -1.2
SCN2A-209ENST00000636071 FAM114A2Q9NRY5 505 aa7.53□□□□□ -1.2
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SCN2A-209ENST00000636071 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.52□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.52□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.52□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.52□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 RUNDC1Q96C34 613 aa7.52□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa7.52□□□□□ -1.21
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SCN2A-209ENST00000636071 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 TAF4BQ92750 862 aa7.52□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 PDE3AQ14432 1141 aa7.52□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 NACAP1Q9BZK3 213 aa7.52□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 A6NNZ2 444 aa7.51□□□□□ -1.21
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SCN2A-209ENST00000636071 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.51□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 CTAGE5O15320 804 aa7.51□□□□□ -1.21
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SCN2A-209ENST00000636071 KRT85P78386 507 aa7.51□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.51□□□□□ -1.21
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SCN2A-209ENST00000636071 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.5□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 DAPK1P53355 1430 aa7.5□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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SCN2A-209ENST00000636071 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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SCN2A-209ENST00000636071 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.49□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA1328Q86T90 577 aa7.49□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.49□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 GOLIM4O00461 696 aa7.49□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 IVLP07476 585 aa7.49□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 GSDMDP57764 484 aa7.49□□□□□ -1.21
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SCN2A-209ENST00000636071 FYCO1Q9BQS8 1478 aa7.49□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 MYOM3Q5VTT5 1437 aa7.49□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 STK38Q15208 465 aa7.49□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 PLVAPQ9BX97 442 aa7.48□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 USP47Q96K76 1375 aa7.48□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 UBXN4Q92575 508 aa7.48□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.48□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.48□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.48□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 CNGA1P29973 690 aa7.48□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 PDILTQ8N807 584 aa7.48□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SCN2A-209ENST00000636071 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
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