RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 CNGA1P29973 690 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 SEMA3FQ13275 785 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 C6orf229H3BNL8 230 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 WDR48Q8TAF3 677 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 KANK1Q14678 1352 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 GINS2Q9Y248 185 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 C8orf37Q96NL8 207 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 PDE4AP27815 886 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CDCA8Q53HL2 280 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CENPHQ9H3R5 247 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 POLD1P28340 1107 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC89Q8N998 374 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 F8W031 263 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 ZPR1O75312 459 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TSC1Q92574 1164 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 ITM2BQ9Y287 266 aa6.29□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 ANO3Q9BYT9 981 aa6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 ZWINTO95229 277 aa6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 FAM212AQ96EL1 285 aa6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 HAUS7Q99871 368 aa6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CAGE1Q8TC20 777 aa6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC175P0C221 793 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 RUFY1Q96T51 708 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 BECN2A8MW95 431 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 DESP17661 470 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 TAF3Q5VWG9 929 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 SLC9A5Q14940 896 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 KLF15Q9UIH9 416 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 CEP83Q9Y592 693 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 SP4Q02446 784 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 VEZTQ9HBM0 779 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 CACNA1FO60840 1977 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 FCHSD2O94868 740 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 FLIIQ13045 1269 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 PPP2R5CQ13362 524 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 MYL6BP14649 208 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 KIF3BO15066 747 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC96Q2M329 555 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 SAMM50Q9Y512 469 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 ABL1P00519 1130 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 TERF1P54274 439 aa6.25□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.25□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 FERMT2Q96AC1 680 aa6.25□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.25□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 NBPF14Q5TI25 921 aa6.25□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 NUCB2P80303 420 aa6.25□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.25□□□□□ -1.41
ZBED6-202ENST00000550078 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.414e-7■■□□□ 12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms