RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-202ENST00000499038 BAP1Q92560 729 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-202ENST00000499038 AXIN1O15169 862 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-202ENST00000499038 CTC1Q2NKJ3 1217 aa10.11□□□□□ -0.79
UBE2B-202ENST00000499038 ALDH1A1P00352 501 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-202ENST00000499038 FAM117AQ9C073 453 aa10.1□□□□□ -0.79
UBE2B-202ENST00000499038 MAP10Q9P2G4 905 aa10.1□□□□□ -0.79
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UBE2B-202ENST00000499038 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
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UBE2B-202ENST00000499038 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.07□□□□□ -0.8
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UBE2B-202ENST00000499038 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.88□□□□□ -0.83
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UBE2B-202ENST00000499038 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2B-202ENST00000499038 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
UBE2B-202ENST00000499038 PNMA1Q8ND90 353 aa9.87□□□□□ -0.83
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UBE2B-202ENST00000499038 TIMP2P16035 220 aa9.86□□□□□ -0.83
UBE2B-202ENST00000499038 FSHRP23945 695 aa9.85□□□□□ -0.83
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UBE2B-202ENST00000499038 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.85□□□□□ -0.83
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UBE2B-202ENST00000499038 GRM5P41594 1212 aa9.84□□□□□ -0.83
UBE2B-202ENST00000499038 ERFEQ4G0M1 354 aa9.84□□□□□ -0.83
UBE2B-202ENST00000499038 ZBTB33Q86T24 672 aa9.84□□□□□ -0.83
UBE2B-202ENST00000499038 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.84□□□□□ -0.83
UBE2B-202ENST00000499038 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
UBE2B-202ENST00000499038 NR3C2P08235 984 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-202ENST00000499038 PTK2Q05397 1052 aa9.83□□□□□ -0.84
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UBE2B-202ENST00000499038 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.82□□□□□ -0.84
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UBE2B-202ENST00000499038 ITPKCQ96DU7 683 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-202ENST00000499038 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2B-202ENST00000499038 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-202ENST00000499038 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
UBE2B-202ENST00000499038 TREML4Q6UXN2 200 aa9.8□□□□□ -0.84
UBE2B-202ENST00000499038 ZFP42Q96MM3 310 aa9.8□□□□□ -0.84
UBE2B-202ENST00000499038 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
UBE2B-202ENST00000499038 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.79□□□□□ -0.84
UBE2B-202ENST00000499038 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
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