RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491843.2

ZNF638-222, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 3

Gene ZNF638, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-222	ENST00000491843	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	PKDCC	Q504Y2	493 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	WNT7B	P56706	349 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	SH3BP2	P78314	561 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ZNF638-222	ENST00000491843	AP1G2	O75843	785 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843	DGAT1	O75907	488 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF511	Q8NB15	262 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843	GOPC	Q9HD26	462 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843		J3QL48	77 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843	RFC5	P40937	340 aa		11.04	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843	MYT1	Q01538	1121 aa		11.04	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843	SMPD1	P17405	629 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843	FOXJ1	Q92949	421 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ZNF638-222	ENST00000491843	SIAH2	O43255	324 aa		11.02	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.02	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	ST8SIA5	O15466	376 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	AGER	Q15109	404 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	NR6A1	Q15406	480 aa		11	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		11	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	HPS1	Q92902	700 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	AAAS	Q9NRG9	546 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	NBPF14	Q5TI25	921 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
ZNF638-222	ENST00000491843	AVP	P01185	164 aa		10.95	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		10.95	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		10.95	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		10.94	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	ARID5B	Q14865	1188 aa		10.94	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		10.94	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	DACH1	Q9UI36	760 aa		10.94	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		10.94	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	AXIN1	O15169	862 aa		10.93	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		10.93	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		10.92	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.91	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		10.91	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		10.9	□□□□□ -0.66
ZNF638-222	ENST00000491843	POTEC	B2RU33	542 aa		10.89	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.89	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	10.89	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.89	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		10.88	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		10.88	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	NNT	Q13423	1086 aa		10.87	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	MPND	Q8N594	471 aa		10.87	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		10.87	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	ADH1C	P00326	375 aa		10.86	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	CDK15	Q96Q40	435 aa		10.86	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	ERFE	Q4G0M1	354 aa		10.85	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	SNRK	Q9NRH2	765 aa		10.85	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	ZBTB33	Q86T24	672 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ZNF638-222	ENST00000491843	NR3C2	P08235	984 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	GRM5	P41594	1212 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	PTK2	Q05397	1052 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	FSHR	P23945	695 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	ADAM32	Q8TC27	787 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	BMP1	P13497	986 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	NR5A1	Q13285	461 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	TIMP2	P16035	220 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ZNF638-222	ENST00000491843	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		10.74	□□□□□ -0.69

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