RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM117AQ9C073 453 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP10Q9P2G4 905 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 CTC1Q2NKJ3 1217 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF511Q8NB15 262 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 AXIN1O15169 862 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SIAH2O43255 324 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 ALDH1A1P00352 501 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 POTECB2RU33 542 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 HPS1Q92902 700 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 DACH1Q9UI36 760 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.02□□□□□ -0.8
RABGGTB-204ENST00000461653 NEUROD2Q15784 382 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXJ1Q92949 421 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 AGERQ15109 404 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 MPNDQ8N594 471 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 NBPF14Q5TI25 921 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 AP1G2O75843 785 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 NNTQ13423 1086 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 ARID5BQ14865 1188 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 IL27Q8NEV9 243 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 ADH1CP00326 375 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.827e-7■□□□□ 11
RABGGTB-204ENST00000461653 CDK15Q96Q40 435 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 GOPCQ9HD26 462 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 SENP2Q9HC62 589 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 RFC5P40937 340 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 NR6A1Q15406 480 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM47Q96LD4 638 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L8P0C7I0 530 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 BMP1P13497 986 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 TIMP2P16035 220 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 KIFC2Q96AC6 838 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 NR5A1Q13285 461 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 GRM5P41594 1212 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 NR3C2P08235 984 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 ERFEQ4G0M1 354 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 FSHRP23945 695 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-204ENST00000461653 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 PNMA1Q8ND90 353 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ITPKCQ96DU7 683 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 PTK2Q05397 1052 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB33Q86T24 672 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 TREML4Q6UXN2 200 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ZFP42Q96MM3 310 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 SCARF1Q14162 830 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms