RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 DMTNQ08495 405 aa26.32■■□□□ 1.8
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ODC1-201ENST00000234111 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.31■■□□□ 1.8
ODC1-201ENST00000234111 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.3■■□□□ 1.8
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ODC1-201ENST00000234111 MORC1Q86VD1 984 aa26.3■■□□□ 1.8
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ODC1-201ENST00000234111 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.1■■□□□ 1.77
ODC1-201ENST00000234111 STAC3Q96MF2 364 aa26.1■■□□□ 1.77
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ODC1-201ENST00000234111 FAM177BA6PVY3 158 aa26.09■■□□□ 1.77
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ODC1-201ENST00000234111 TRPM2O94759 1503 aa26.06■■□□□ 1.76
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ODC1-201ENST00000234111 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
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ODC1-201ENST00000234111 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
ODC1-201ENST00000234111 KIF20AO95235 890 aa26.04■■□□□ 1.76
ODC1-201ENST00000234111 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
ODC1-201ENST00000234111 ADGRL1O94910 1474 aa26.02■■□□□ 1.76
ODC1-201ENST00000234111 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
ODC1-201ENST00000234111 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
ODC1-201ENST00000234111 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.76
ODC1-201ENST00000234111 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.01■■□□□ 1.75
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