RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562443.1

CFAP20-202, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, humanhuman

TSL 5

Gene CFAP20, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20-202ENST00000562443 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 A0A1W2PQ67 120 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 TTC34A8MYJ7 566 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 FOXO6A8MYZ6 492 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 RSPH10B2B2RC85 870 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 RASA4BC9J798 803 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 MYO1CO00159 1063 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 EXOC5O00471 708 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 NR5A2O00482 541 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 PLD2O14939 933 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 LATO43561 262 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 CA12O43570 354 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 RGS10O43665 173 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ITM2AO43736 263 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 SRGAP2O75044 1071 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 UNC5CO95185 931 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 GRPP07492 148 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 INHBAP08476 426 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 FGRP09769 529 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 RSPH10BP0C881 870 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 TRIM49P0CI25 452 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 TRIM49CP0CI26 452 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 SLC5A1P13866 664 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 NAGAP17050 411 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 KLK2P20151 261 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ADRA1DP25100 572 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 YY1P25490 414 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 NDUFS1P28331 727 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 EPHA3P29320 983 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 PRKAR1BP31321 381 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 SLC5A2P31639 672 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 MCM5P33992 734 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ADCYAP1R1P41586 468 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 SOX2P48431 317 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 LSSP48449 732 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 LIMK2P53671 638 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 LYZP61626 148 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 GNB1P62873 340 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 TLE1Q04724 770 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 TLE4Q04727 773 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 RUNX1T1Q06455 604 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 TCF15Q12870 199 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 COX10Q12887 443 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ZBTB17Q13105 803 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 NFATC2Q13469 925 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 RAPSNQ13702 412 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ITGA9Q13797 1035 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 TNFAIP1Q13829 316 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 CCNIQ14094 377 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 CCDC27Q2M243 656 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF284Q2VY69 593 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 XKR9Q5GH70 373 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ENTPD8Q5MY95 495 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 FHL5Q5TD97 284 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 CACHD1Q5VU97 1274 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 SFMBT2Q5VUG0 894 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 TBC1D9BQ66K14 1250 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 SEL1L3Q68CR1 1132 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 SLC35E4Q6ICL7 350 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 PPP4R3AQ6IN85 833 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 DOK6Q6PKX4 331 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 TIFABQ6ZNK6 161 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 NEK10Q6ZWH5 1172 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 MON1BQ7L1V2 547 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF367Q7RTV3 350 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 KDELC2Q7Z4H8 507 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 NFE4Q86UQ8 179 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 KCNMB4Q86W47 210 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 MARCH9Q86YJ5 346 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 RHPN2Q8IUC4 686 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF547Q8IVP9 402 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 PARP8Q8N3A8 854 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 DPP10Q8N608 796 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF441Q8N8Z8 693 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 LRRC57Q8N9N7 239 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 SLC24A4Q8NFF2 622 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 OR1N1Q8NGS0 311 aa0.07□□□□□ -2.4
CFAP20-202ENST00000562443 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms