RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP11A	P98196	1134 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF33A	Q06730	810 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ENPP2	Q13822	863 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CDO1	Q16878	200 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXL22	Q6P050	247 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	C3orf20	Q8ND61	904 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TBCB	Q99426	244 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PIGV	Q9NUD9	493 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	THADA	Q6YHU6	1953 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	EPHB6	O15197	1021 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HLA-E	P13747	358 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	BCKDHB	P21953	392 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKCH	P24723	683 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1E1	P30953	314 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPN9	P43378	593 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	AIF1	P55008	147 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FANCC	Q00597	558 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	C2CD6	Q53TS8	623 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	NT5C3B	Q969T7	300 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SKA1	Q96BD8	255 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	OMD	Q99983	421 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	EDEM2	Q9BV94	578 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM245	Q9H330	911 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PARVA	Q9NVD7	372 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	11.67	□□□□□ -0.54	9e-9	■□□□□ 11
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC53	A6NM62	1247 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246		E9PAM4	449 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX33	O43247	280 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF8	O76064	485 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ADCY5	O95622	1261 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ADH1B	P00325	375 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	MYBL1	P10243	752 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXC13	P31276	330 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FLT3	P36888	993 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TPMT	P51580	245 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PLK1	P53350	603 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	LIMK1	P53667	647 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC6	Q16204	474 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	EFHC2	Q5JST6	749 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM215	Q68D42	235 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	LUZP1	Q86V48	1076 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM131B	Q86XD5	332 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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