RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 COPAP53621 1224 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 OXCT1P55809 520 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ATP11AP98196 1134 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ELF2Q15723 593 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PLEKHG6Q3KR16 790 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 RAB6CQ53S08 254 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PMS2CLQ68D20 193 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 APCDD1Q8J025 514 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ALG14Q96F25 216 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 MRGPRX3Q96LB0 322 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SELENOOQ9BVL4 669 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 RAB6CQ9H0N0 254 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 CLDN11O75508 207 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 MOCS3O95396 460 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 CDH4P55283 916 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 KLHL30Q0D2K2 578 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SPEM2Q0P670 501 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ARID5BQ14865 1188 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SPDYCQ5MJ68 293 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 HGSNATQ68CP4 663 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 FAM131BQ86XD5 332 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 KIAA2013Q8IYS2 634 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ERLEC1Q96DZ1 483 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SPACA7Q96KW9 195 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SLC6A17Q9H1V8 727 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ITM2CQ9NQX7 267 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SUN2Q9UH99 717 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 OR51B4Q9Y5P0 310 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ITIH6Q6UXX5 1313 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 CNTN5O94779 1100 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SKILP12757 684 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 HLA-EP13747 358 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 RRM1P23921 792 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ADRA1BP35368 520 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 GGCXP38435 758 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 HDAC4P56524 1084 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ZBED6P86452 979 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ECT2LQ008S8 904 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 CSRP2Q16527 193 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PLA2G2CQ5R387 149 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 TMPRSS6Q8IU80 811 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 OR52K2Q8NGK3 314 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 FEM1AQ9BSK4 669 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PRSS16Q9NQE7 514 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ERVW-1Q9UQF0 538 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SNX10Q9Y5X0 201 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ABCA7Q8IZY2 2146 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 GPD1P21695 349 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 VASPP50552 380 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ALFQ53S48 1182 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 DNAJC24Q6P3W2 148 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 LRRC31Q6UY01 552 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SLC36A4Q6YBV0 504 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 OR2T3Q8NH03 318 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 FAM172AQ8WUF8 416 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PPP1R9BQ96SB3 815 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 OSBPL2Q9H1P3 480 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 FBRSQ9HAH7 460 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SEMA4GQ9NTN9 838 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SPAG17Q6Q759 2223 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 E9PAM4 449 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 RTN2O75298 545 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 FTLP02792 175 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 GYPCP04921 128 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ZNF806P0C7X5 589 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ST8SIA6P61647 398 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SULT2A1Q06520 285 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 MAMLD1Q13495 774 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 CDO1Q16878 200 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 LPCAT2Q7L5N7 544 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ZNF366Q8N895 744 aa19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms