RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	PTK6	Q13882	451 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	IGSF8	Q969P0	613 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TTI1	O43156	1089 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	GCAT	O75600	419 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CSPG5	O95196	566 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	UQCRH	P07919	91 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	GJA1	P17302	382 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ITIH2	P19823	946 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CCNC	P24863	283 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC6A4	P31645	630 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	DYNLT1	P63172	113 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CBLB	Q13191	982 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SNX1	Q13596	522 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	NPNT	Q6UXI9	565 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CHSY1	Q86X52	802 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	WBP2	Q969T9	261 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	HDAC11	Q96DB2	347 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	VAT1	Q99536	393 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MYO7A	Q13402	2215 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SMAP	O00193	183 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	FSHR	P23945	695 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	NTHL1	P78549	312 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TNK2	Q07912	1038 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	BRD3	Q15059	726 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	P3H1	Q32P28	736 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	PARP15	Q460N3	678 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ALF	Q53S48	1182 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	POTEH	Q6S545	545 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	LGI2	Q8N0V4	545 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	NPW	Q8N729	165 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	BBOF1	Q8ND07	529 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MAGEH1	Q9H213	219 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MPP6	Q9NZW5	540 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	WHRN	Q9P202	907 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		13.09	□□□□□ -0.31

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