RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ZHX3Q9H4I2 956 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SEMA4GQ9NTN9 838 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PKP3Q9Y446 797 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 FAM90A7PA6NKC0 464 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 FAM90A12PA8MX19 464 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 B4E171 279 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 PGM1P36871 562 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TSPAN7P41732 249 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 SOX2P48431 317 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 MVDP53602 400 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 COL10A1Q03692 680 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 SEC23BQ15437 767 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 BAK1Q16611 211 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PROSER3Q2NL68 480 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB10Q96DT7 871 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 KLQ9UEF7 1012 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 SUFUQ9UMX1 484 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 INSL6Q9Y581 213 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 CYP4B1P13584 511 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 DHRS13Q6UX07 377 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 DBX2Q6ZNG2 339 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGEF25Q86VW2 580 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM200AQ86VY9 491 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
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