RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 TTC39AQ5SRH9 613 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 TTLL5Q6EMB2 1281 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERAP2Q6P179 960 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 PELI3Q8N2H9 469 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLEC4CQ8WTT0 213 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 IP6K1Q92551 441 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 KAT2AQ92830 837 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLMNQ96JQ2 1002 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAMK1GQ96NX5 476 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 TASP1Q9H6P5 420 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 OBP2BQ9NPH6 170 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF580Q9UK33 172 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRCH1Q9Y2L9 728 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 LGALS16A8MUM7 142 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 FOXO6A8MYZ6 492 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 GYS1P13807 737 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGFBP2P18065 325 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYP3A7P24462 503 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHRNA5P30532 468 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 PGGT1BP53609 377 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 PGBD2Q6P3X8 592 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 SVIPQ8NHG7 77 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM71BQ8TC56 605 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP2A3Q93084 1043 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZPBPQ9BS86 351 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPAG4Q9NPE6 437 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 AGAP5A6NIR3 686 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC38A8A6NNN8 435 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 EFCAB8A8MWE9 144 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFNA2P01563 188 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 CBSLP0DN79 551 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 CBSP35520 551 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADPRHP54922 357 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERV3-1Q14264 604 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTK2BQ14289 1009 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPS6KA2Q15349 733 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPR162Q16538 588 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 PFKFB4Q16877 469 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ALG10Q5BKT4 473 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 WASHC2DQ5SRD0 308 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 MDGA2Q7Z553 956 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM200AQ86VY9 491 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLBQ86Z14 1044 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 EXD3Q8N9H8 876 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ISCUQ9H1K1 167 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHST12Q9NRB3 414 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 WWOXQ9NZC7 414 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 TTC3P53804 2025 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM90A18PA6NE21 464 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM90A16PA6NEW6 464 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 LACTBL1A8MY62 500 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNJ18B7U540 433 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 MCIDASD6RGH6 385 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 MDM4O15151 490 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 NEURL1O76050 574 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCKP06239 509 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ITGA2BP08514 1039 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM90A15PP0C7V4 464 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM90A14PP0C7W9 464 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 SETSIPP0DME0 302 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 HOXB2P14652 356 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLRC2P26717 231 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 STAT1P42224 750 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCP4P48539 62 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 RCAN1P53805 252 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP10-9P60411 292 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLHL22Q53GT1 634 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYCP2LQ5T4T6 812 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 PARM1Q6UWI2 310 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms