RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 SFMBT2Q5VUG0 894 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 LRSAM1Q6UWE0 723 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 C11orf74Q86VG3 221 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 CARNMT1Q8N4J0 409 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 IGSF8Q969P0 613 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 TMEM245Q9H330 911 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 GMEB2Q9UKD1 530 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 PLA2G4CQ9UP65 541 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 RAD54BQ9Y620 910 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 DLDP09622 509 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 KRT3P12035 628 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 PDGFRAP16234 1089 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 TNFAIP3P21580 790 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 FUT11Q495W5 492 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 RABGAP1LQ5R372 815 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 C14orf80Q86SX3 495 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 ZNF683Q8IZ20 524 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 EMC1Q8N766 993 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 C3orf20Q8ND61 904 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 JOSD2Q8TAC2 188 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 RXFP2Q8WXD0 754 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 VCPIP1Q96JH7 1222 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 INVSQ9Y283 1065 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 A0A1B0GVM2 712 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 TCAF2A6NFQ2 919 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 SIGLEC16A6NMB1 481 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 H0Y626 953 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 LRP3O75074 770 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 RHOBTB1O94844 696 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 NDUFV2P19404 249 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 RDXP35241 583 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 PTPN9P43378 593 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 PLK1P53350 603 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 SLC12A1Q13621 1099 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 CDH18Q13634 790 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 ASIC2Q16515 512 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 MCOLN2Q8IZK6 566 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 PGBD3Q8N328 593 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 MRGPRX1Q96LB2 322 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 HAPLN3Q96S86 360 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 HINFPQ9BQA5 517 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 HAUS4Q9H6D7 363 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
NISCH-209ENST00000485765 DRGXA6NNA5 263 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 EPN2O95208 641 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 GJB6O95452 261 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ASLP04424 464 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 BCKDHBP21953 392 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PRKCHP24723 683 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 STARD3Q14849 445 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PITRM1Q5JRX3 1037 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 WDR59Q6PJI9 974 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 STRADAQ7RTN6 431 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 FRMD1Q8N878 549 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 KDM1BQ8NB78 822 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 RLN3Q8WXF3 142 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 IQCDQ96DY2 449 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 MYO19Q96H55 970 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SIK2Q9H0K1 926 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 TSPY26PQ9H489 355 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 PARD6AQ9NPB6 346 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 TAS2R14Q9NYV8 317 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 IFNKQ9P0W0 207 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 VANGL2Q9ULK5 521 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 CAPN11Q9UMQ6 739 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 ZNF217O75362 1048 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 EPHX1P07099 455 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 GZMAP12544 262 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 SDC4P31431 198 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 CSKP41240 450 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-209ENST00000485765 IRAK1P51617 712 aa19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms