RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580081.1

CLTC-212, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 4

Gene CLTC, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-212ENST00000580081 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ADCY2Q08462 1091 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 NOMO1Q15155 1222 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ELF2Q15723 593 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 MANEALQ5VSG8 457 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 TTC27Q6P3X3 843 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 GAREM2Q75VX8 874 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 PLD5Q8N7P1 536 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ACTL9Q8TC94 416 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 P3H4Q92791 437 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 AZIN2Q96A70 460 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 TBC1D31Q96DN5 1066 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 STIM2Q9P246 746 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 RAD54BQ9Y620 910 aa9.06□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 C2orf78A6NCI8 922 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 FAM72CH0Y354 149 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ZNF197O14709 1029 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 MCF2LO15068 1137 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 RAD51CO43502 376 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 RFPL2O75678 378 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 LRIG2O94898 1065 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ECEL1O95672 775 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 GAS8O95995 478 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ITGAVP06756 1048 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 RHOP08100 348 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 HMBSP08397 361 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 SRGAP2BP0DMP2 458 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 HDCP19113 662 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 AMPD1P23109 780 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 EPHB2P29323 1055 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 SERPINB6P35237 376 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 SLC11A2P49281 568 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 SLC7A9P82251 487 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 OASLQ15646 514 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 FAM72AQ5TYM5 149 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 FAM72DQ6L9T8 149 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 LRRC31Q6UY01 552 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 FAM72BQ86X60 149 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ATL2Q8NHH9 583 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 SLC35B2Q8TB61 432 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 HAUS1Q96CS2 278 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 MAGEB5Q9BZ81 275 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 RNF38Q9H0F5 515 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 SIK2Q9H0K1 926 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 RAB17Q9H0T7 212 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 DONSONQ9NYP3 566 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 AMACRQ9UHK6 382 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 HS3ST4Q9Y661 456 aa9.05□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.04□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.04□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 A0A1W2PRU2 124 aa9.04□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 CFAP69A5D8W1 941 aa9.04□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 WASH4PA8MWX3 477 aa9.04□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 HACD1B0YJ81 288 aa9.04□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 E9PAM4 449 aa9.04□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 DYNC1I1O14576 645 aa9.04□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 DCLK1O15075 740 aa9.04□□□□□ -0.96
CLTC-212ENST00000580081 TTI1O43156 1089 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms