RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554186.1

LINC00520-201, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00520, Length 831 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-201ENST00000554186 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.72□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 MYH11P35749 1972 aa4.72□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 ALPK3Q96L96 1907 aa4.72□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa4.72□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 FRMD3A2A2Y4 597 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 RSPH10B2B2RC85 870 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 HAS3O00219 553 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 LAD1O00515 517 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 STAM2O75886 525 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 LYPLA2O95372 231 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 GGPS1O95749 300 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 PFKMP08237 780 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 PDGFRBP09619 1106 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 RSPH10BP0C881 870 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 CYP11B2P19099 503 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 HOXC8P31273 242 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 CCNA1P78396 465 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 CYP4A11Q02928 519 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 TRAF1Q13077 416 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 DRP2Q13474 957 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 CAMK4Q16566 473 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 MARCH8Q5T0T0 291 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 FRMD7Q6ZUT3 714 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 DPP9Q86TI2 863 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 PIGOQ8TEQ8 1089 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 AFG1LQ8WV93 481 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 RAD54LQ92698 747 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 C8orf48Q96LL4 319 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 TIGD1Q96MW7 591 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 STRA6Q9BX79 667 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 BLZF1Q9H2G9 400 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 MS4A5Q9H3V2 200 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 LRWD1Q9UFC0 647 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa4.71□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 ASB14A6NK59 587 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 CHMP2AO43633 222 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 BMP15O95972 392 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 TGFB3P10600 412 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 RGS2P41220 211 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 SYKP43405 635 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 RARRES1P49788 294 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 CASP5P51878 434 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 BEX3Q00994 111 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 MORC3Q14149 939 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 GIT2Q14161 759 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 PLCB4Q15147 1175 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 METTL7BQ6UX53 244 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 GPR149Q86SP6 731 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 C4orf19Q8IY42 314 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 AFAP1L1Q8TED9 768 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 GAB3Q8WWW8 586 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 NELL1Q92832 810 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 DHX58Q96C10 678 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 AK8Q96MA6 479 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 LXNQ9BS40 222 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 TEKT3Q9BXF9 490 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 VTA1Q9NP79 307 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 SLC9A2Q9UBY0 812 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 MAN1B1Q9UKM7 699 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa4.7□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 ANK1P16157 1881 aa4.69□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 FSD2A1L4K1 749 aa4.69□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 CGB1A6NKQ9 187 aa4.69□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 DIRC3C9JPN6 131 aa4.69□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 FKBP9O95302 570 aa4.69□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 EYA4O95677 639 aa4.69□□□□□ -1.66
LINC00520-201ENST00000554186 PGK1P00558 417 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms