RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559974.5

RABGGTA-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,963 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-212ENST00000559974 AP1G2O75843 785 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PRKCHP24723 683 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 MGAT3Q09327 533 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 GALNTL6Q49A17 601 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SPATA13Q96N96 652 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PLAC1Q9HBJ0 212 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 GGT7Q9UJ14 662 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 NOD1Q9Y239 953 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 TET1Q8NFU7 2136 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PTPRDP23468 1912 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 NRP1O14786 923 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 GPR182O15218 404 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 APOEP02649 317 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ADRA1DP25100 572 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SCNN1GP51170 649 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 DAOAP59103 153 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 NME3Q13232 169 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 MBTPS1Q14703 1052 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 RPAINQ86UA6 219 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 LRRC6Q86X45 466 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC63Q8NA47 563 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PCED1BQ96HM7 432 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 LGMNQ99538 433 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SMOQ99835 787 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PIGVQ9NUD9 493 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CDH9Q9ULB4 789 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CAPN9O14815 690 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 LPXNO60711 386 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 FYNP06241 537 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ALADP13716 330 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ITGB8P26012 769 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 FDFT1P37268 417 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 AIF1P55008 147 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SLC18A2Q05940 514 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 MGAT5Q09328 741 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 RAB41Q5JT25 222 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 FITM2Q8N6M3 262 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PPM1NQ8N819 430 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 APOPT1Q96IL0 206 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SERAC1Q96JX3 654 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SLC9A7Q96T83 725 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 C9IYK1 514 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 E7ENQ6 273 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CREB3O43889 395 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CKBP12277 381 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 GLUD2P49448 558 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CDK16Q00536 496 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 DPYSQ14117 519 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PDK1Q15118 436 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 UPP1Q16831 310 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 NTAN1Q96AB6 310 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 KCNK16Q96T55 309 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 VPS11Q9H270 941 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms