RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
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PTX4-201ENST00000293922 IRGQQ8WZA9 623 aa19.01■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 EXOC4Q96A65 974 aa19.01■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
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PTX4-201ENST00000293922 NACA2Q9H009 215 aa19.01■□□□□ 0.63
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PTX4-201ENST00000293922 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP19.01■□□□□ 0.63
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PTX4-201ENST00000293922 FBXO43Q4G163 708 aa19■□□□□ 0.63
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PTX4-201ENST00000293922 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa19■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 KRT3P12035 628 aa19■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 RARGP13631 454 aa19■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 HOXA6P31267 233 aa19■□□□□ 0.63
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PTX4-201ENST00000293922 SLC6A11P48066 632 aa18.98■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 DCUN1D2Q6PH85 259 aa18.98■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 HTR3DQ70Z44 454 aa18.98■□□□□ 0.63
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PTX4-201ENST00000293922 LONP2Q86WA8 852 aa18.98■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 C12orf40Q86WS4 652 aa18.98■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa18.98■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 JOSD2Q8TAC2 188 aa18.98■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 FNIP1Q8TF40 1166 aa18.98■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 RUBCNQ92622 972 aa18.98■□□□□ 0.63
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PTX4-201ENST00000293922 DNMT3LQ9UJW3 386 aa18.98■□□□□ 0.63
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PTX4-201ENST00000293922 K7EQS6 105 aa18.97■□□□□ 0.63
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PTX4-201ENST00000293922 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 C10orf120Q5SQS8 335 aa18.97■□□□□ 0.63
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PTX4-201ENST00000293922 POPDC2Q9HBU9 364 aa18.97■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 LCMT1Q9UIC8 334 aa18.97■□□□□ 0.63
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PTX4-201ENST00000293922 HRO43593 1189 aa18.96■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 DAB1O75553 588 aa18.96■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 GRAP2O75791 330 aa18.96■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 MOCS3O95396 460 aa18.96■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 LTFP02788 710 aa18.96■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 FLT3P36888 993 aa18.96■□□□□ 0.63
PTX4-201ENST00000293922 BSPRYQ5W0U4 402 aa18.96■□□□□ 0.63
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