RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gcnt3Q5JCT0 437 aa15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mxd4Q60948 209 aa15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Parp6Q6P6P7 630 aa15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q8BGA7 448 aa15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fzd10Q8BKG4 582 aa15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem82Q8R115 356 aa15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TgdsQ8VDR7 355 aa15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NonoQ99K48 473 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Polr3hQ9D2C6 204 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 1700001O22RikA2APZ1 375 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 UmpsP13439 481 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 VdrP48281 422 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MipP51180 263 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Npdc1Q64322 332 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Orai3Q6P8G8 290 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc63Q8CDV6 558 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Akr1c14Q91WT7 323 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Psma2P49722 234 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RnaselQ05921 735 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CcnjlQ5SRT8 387 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trpm4Q7TN37 1213 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Scara3Q8C850 606 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pcdhb2Q91Y00 799 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdk9Q99J95 372 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AadacQ99PG0 398 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sike1Q9CPR7 207 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930449I24RikQ9D5E3 319 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smok3aC0HKC8 504 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smok3bC0HKC9 504 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10717D3Z1I8 228 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp651E9PZ11 729 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Unc5cO08747 931 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trove2O08848 538 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ctnnal1O88327 731 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gabpb1Q00420 383 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tp53i13Q5F267 385 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bcar1Q61140 874 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 DazlQ64368 298 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Polr2eQ80UW8 210 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Xylt1Q811B1 953 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Iars2Q8BIJ6 1012 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnc4Q8R1C0 628 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r203Q8R273 311 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pcdha11Q91Y19 950 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PllpQ9DCU2 182 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MycsQ9Z304 431 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rtl9Q32KG4 1339 aa15.38■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5485A0A1D5RM98 91 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Itga9B8JK39 1036 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm21293E9Q4G9 266 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trim55G3X8Y1 545 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vps51Q3UVL4 782 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ScapQ6GQT6 1276 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Afap1l1Q8BZI0 768 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atg14Q8CDJ3 492 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hip1Q8VD75 1029 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il2P04351 169 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pdcd2P46718 343 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rasgrf2P70392 1189 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gpr15Q0VDU3 360 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spata24Q6P926 205 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr784Q8VFZ9 319 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sec63Q8VHE0 760 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp11Q99K46 921 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atg2aQ6P4T0 1914 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr611K7N609 323 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr612L7N462 323 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PenkP22005 268 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MylpfP97457 169 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arhgap45Q3TBD2 1116 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spa17Q62252 149 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gdpd5Q640M6 607 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp43Q8BUM9 1132 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc186Q8C9S4 917 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il17rbQ9JIP3 499 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ror1Q9Z139 937 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mtm1Q9Z2C5 603 aa15.37■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa15.36■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc13D3YV10 709 aa15.36■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 E230025N22RikG5E8S3 482 aa15.36■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pde6bP23440 856 aa15.36■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 E330034G19RikQ3UWX6 351 aa15.36■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mef2dQ63943 514 aa15.36■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf219Q6IQX8 726 aa15.36■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ssxb5Q6XAS2 159 aa15.36■□□□□ 0.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp454Q80Y34 536 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.1 ms