Protein–RNA interactions for Protein: A4FUQ5

Fpr-rs4, Formyl peptide receptor-related sequence 4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
Fpr-rs4A4FUQ5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Fpr-rs4A4FUQ5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Fpr-rs4A4FUQ5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fpr-rs4A4FUQ5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Fpr-rs4A4FUQ5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Fpr-rs4A4FUQ5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fpr-rs4A4FUQ5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Fpr-rs4A4FUQ5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fpr-rs4A4FUQ5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fpr-rs4A4FUQ5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fpr-rs4A4FUQ5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Fpr-rs4A4FUQ5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Fpr-rs4A4FUQ5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fpr-rs4A4FUQ5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fpr-rs4A4FUQ5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Fpr-rs4A4FUQ5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fpr-rs4A4FUQ5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fpr-rs4A4FUQ5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fpr-rs4A4FUQ5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fpr-rs4A4FUQ5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Fpr-rs4A4FUQ5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fpr-rs4A4FUQ5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fpr-rs4A4FUQ5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Fpr-rs4A4FUQ5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fpr-rs4A4FUQ5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fpr-rs4A4FUQ5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fpr-rs4A4FUQ5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Fpr-rs4A4FUQ5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fpr-rs4A4FUQ5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Fpr-rs4A4FUQ5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fpr-rs4A4FUQ5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fpr-rs4A4FUQ5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fpr-rs4A4FUQ5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fpr-rs4A4FUQ5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fpr-rs4A4FUQ5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fpr-rs4A4FUQ5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fpr-rs4A4FUQ5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Fpr-rs4A4FUQ5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fpr-rs4A4FUQ5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Fpr-rs4A4FUQ5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Fpr-rs4A4FUQ5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Fpr-rs4A4FUQ5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Fpr-rs4A4FUQ5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fpr-rs4A4FUQ5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fpr-rs4A4FUQ5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fpr-rs4A4FUQ5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Fpr-rs4A4FUQ5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fpr-rs4A4FUQ5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Fpr-rs4A4FUQ5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Fpr-rs4A4FUQ5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fpr-rs4A4FUQ5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Fpr-rs4A4FUQ5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Fpr-rs4A4FUQ5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Fpr-rs4A4FUQ5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Fpr-rs4A4FUQ5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fpr-rs4A4FUQ5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Fpr-rs4A4FUQ5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fpr-rs4A4FUQ5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fpr-rs4A4FUQ5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fpr-rs4A4FUQ5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fpr-rs4A4FUQ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fpr-rs4A4FUQ5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fpr-rs4A4FUQ5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Fpr-rs4A4FUQ5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fpr-rs4A4FUQ5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fpr-rs4A4FUQ5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fpr-rs4A4FUQ5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fpr-rs4A4FUQ5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fpr-rs4A4FUQ5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fpr-rs4A4FUQ5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fpr-rs4A4FUQ5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fpr-rs4A4FUQ5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fpr-rs4A4FUQ5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Fpr-rs4A4FUQ5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fpr-rs4A4FUQ5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fpr-rs4A4FUQ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fpr-rs4A4FUQ5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Fpr-rs4A4FUQ5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fpr-rs4A4FUQ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fpr-rs4A4FUQ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fpr-rs4A4FUQ5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fpr-rs4A4FUQ5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fpr-rs4A4FUQ5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fpr-rs4A4FUQ5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Fpr-rs4A4FUQ5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fpr-rs4A4FUQ5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Fpr-rs4A4FUQ5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms