RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334		H7C1Q1	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	MASP2	O00187	686 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CLIC1	O00299	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ACTL6B	O94805	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	HAL	P42357	657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	AOX1	Q06278	1338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334		M0QYT0	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PPP6R2	O75170	966 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PROP1	O75360	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	C1R	P00736	705 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PEPD	P12955	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	MMP8	P22894	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	JAK3	P52333	1124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PROK1	P58294	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	C21orf58	P58505	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	TFF2	Q03403	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	KCNB1	Q14721	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	RITA1	Q96K30	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	MECR	Q9BV79	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	TISP43	B9A030	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CYP2D6	P10635	497 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CD38	P28907	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	THBS4	P35443	961 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	GRK6	P43250	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	AP2B1	P63010	937 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	FOXO1	Q12778	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PRKG1	Q13976	671 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	POSTN	Q15063	836 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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