RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 GPC5P78333 572 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 LMAN2Q12907 356 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 HECTD2Q5U5R9 776 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 DENND2CQ68D51 928 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 LAIR1Q6GTX8 287 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ACSM6Q6P461 480 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 C16orf89Q6UX73 402 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF627Q7L945 461 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CPOQ8IVL8 374 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PAF1Q8N7H5 531 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ASB12Q8WXK4 309 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SLC9A6Q92581 669 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 GOLGA1Q92805 767 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 FAR2Q96K12 515 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MAF1Q9H063 256 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RIC8AQ9NPQ8 531 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 VPS45Q9NRW7 570 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 GGA3Q9NZ52 723 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF69Q9UC07 566 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 KCND3Q9UK17 655 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MYRFQ9Y2G1 1151 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 EYA2O00167 538 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PRAMEF2O60811 474 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 KRT38O76015 456 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PDE8BO95263 885 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 POLBP06746 335 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 KRT4P19013 534 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CD53P19397 219 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TNFRSF1AP19438 455 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RXRAP19793 462 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MATN1P21941 496 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CNTFP26441 200 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RPL15P61313 204 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CBFBQ13951 182 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TBRG1Q3YBR2 411 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF569Q5MCW4 686 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD40Q6AI12 368 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 KIRREL2Q6UWL6 708 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SYT13Q7L8C5 426 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TMTC1Q8IUR5 882 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SLC2A12Q8TD20 617 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 GLMPQ8WWB7 406 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D5Q92609 795 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 COG8Q96MW5 612 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SNX18Q96RF0 628 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TOR3AQ9H497 397 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CHODLQ9H9P2 273 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TMLHEQ9NVH6 421 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ANAPC4Q9UJX5 808 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RAB21Q9UL25 225 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM191CA6NGB0 347 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TISP43B9A030 160 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF213O14771 459 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MGST3O14880 152 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CYP3A4P08684 503 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CNPP09543 421 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 FAM163BP0C2L3 166 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 INSRRP14616 1297 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 GALNSP34059 522 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RARRES1P49788 294 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 FOXL2P58012 376 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TAS2R50P59544 299 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.4 ms