RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222374.2

CADM4-201, Transcript of cell adhesion molecule 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CADM4, Length 2,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4-201ENST00000222374 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 VSTM1Q6UX27 236 aa24.55■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 HOOK3Q86VS8 718 aa24.55■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 FAM71DQ8N9W8 422 aa24.55■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 MDM1Q8TC05 714 aa24.55■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 ADAM32Q8TC27 787 aa24.55■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 PGM2Q96G03 612 aa24.55■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa24.55■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 GOLGA8MH3BSY2 632 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TNFRSF10BO14763 440 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 RASGRF2O14827 1237 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 LSP1P33241 339 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 PPP2R2AP63151 447 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 AUHQ13825 339 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 SLC9A4Q6AI14 798 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 C1orf228Q6PIY5 440 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 PQLC3Q8N755 202 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 BBOF1Q8ND07 529 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TRIM62Q9BVG3 475 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 PCDH9Q9HC56 1237 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 BANF1O75531 89 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TIMP1P01033 207 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 RBP3P10745 1247 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TGM2P21980 687 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 CCDC38Q502W7 563 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 ANKRD22Q5VYY1 191 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 PLD5Q8N7P1 536 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 SLC9A7Q96T83 725 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TMEM109Q9BVC6 243 aa24.54■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 SEC24CP53992 1094 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 MTM1Q13496 603 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 NOMO1Q15155 1222 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 RTP2Q5QGT7 225 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TTPALQ9BTX7 342 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 DDIT4Q9NX09 232 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 CPB1P15086 417 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 ITGB8P26012 769 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 ARPP19P56211 112 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 RSAD2Q8WXG1 361 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TOP1MTQ969P6 601 aa24.53■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 H7C4K7 107 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TRIM66O15016 1216 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 F9P00740 461 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 CSF2RAP15509 400 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 ARL4AP40617 200 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 BCAS4Q8TDM0 211 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 CSPG4P5Q96PW8 444 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 SAYSD1Q9NPB0 183 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 HEY1Q9Y5J3 304 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 MAGEA4P43358 317 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 MAGEA11P43364 429 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 AIF1P55008 147 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 DDR2Q16832 855 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 EFHC2Q5JST6 749 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 BEND5Q7L4P6 421 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TAS1R1Q7RTX1 841 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 ATAD1Q8NBU5 361 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 C8orf48Q96LL4 319 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TSPYL1Q9H0U9 437 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 CWH43Q9H720 699 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.527e-8■■■■■ 68.3
CADM4-201ENST00000222374 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CADM4-201ENST00000222374 RAG1P15918 1043 aa24.51■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa24.51■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 CPT1BQ92523 772 aa24.51■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 TBC1D4O60343 1298 aa24.5■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 GOT1P17174 413 aa24.5■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 ADRA1BP35368 520 aa24.5■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 GPR17Q13304 367 aa24.5■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 SYCP2LQ5T4T6 812 aa24.5■■□□□ 1.51
CADM4-201ENST00000222374 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.1 ms