RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VSTM1Q6UX27 236 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCGF5Q86SE9 256 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOC4Q96A65 974 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFAP69A5D8W1 941 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIPK2O43353 540 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GALTP07902 379 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRIK1P39086 918 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGEA11P43364 429 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC5A3P53794 718 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GYS2P54840 703 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NME3Q13232 169 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF280DQ6N043 979 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC25Q86WR0 208 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARMC5Q96C12 935 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTP4Q96DX8 246 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RFC2P35250 354 aa22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADRA1BP35368 520 aa22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XRCC4Q13426 336 aa22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFHC2Q5JST6 749 aa22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FUT10Q6P4F1 479 aa22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYZAPP0CAP1 466 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOT1P17174 413 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPL22P35268 128 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC29A2Q14542 456 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PYROXD2Q8N2H3 581 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF139Q8WU17 664 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C8orf48Q96LL4 319 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HCSTQ9UBK5 93 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 H3BRJ5 948 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 H7C0C1 242 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMAPO00193 183 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM66O15016 1216 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP5OP48047 213 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CXCR3P49682 368 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IKBKEQ14164 716 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOOK3Q86VS8 718 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP29Q9HBJ7 922 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDIT4Q9NX09 232 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D4O60343 1298 aa22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGLV3-25P01717 112 aa22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJA8P48165 433 aa22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAM32Q8TC27 787 aa22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EDEM1Q92611 657 aa22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VWCEQ96DN2 955 aa22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COX16Q9P0S2 106 aa22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL4A6Q14031 1691 aa22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC4O95801 387 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMARCB1Q12824 385 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEMA3BQ13214 749 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms