RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000126429.7

Ccdc171-204, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc171, Length 1,388 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 MslnQ61468 625 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Fam102aQ78T81 392 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Mettl3Q8C3P7 580 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Nlrp10Q8CCN1 673 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Mill2Q8HWE5 355 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 RabepkQ8VCH5 380 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Sh2b1Q91ZM2 756 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Fam212aQ9CX62 282 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 IscuQ9D7P6 168 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Eef1akmt2Q9D853 244 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Angptl2Q9R045 493 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 FancfE9Q5Z5 343 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Gm3371F7CQW8 167 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 DxoO70348 397 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Chrm1P12657 460 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 CremP27699 357 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 DctP29812 517 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 UrosP51163 265 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 GscQ02591 256 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Phactr1Q2M3X8 580 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Zbtb16Q3UQ17 673 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Foxr1Q3UTB7 268 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Creb3Q61817 404 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Jak2Q62120 1129 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Mef2dQ63943 514 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ano6Q6P9J9 911 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Adam29Q811Q4 763 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Tmem108Q8BHE4 574 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Dclk3Q8BWQ5 790 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Cdk17Q8K0D0 523 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Spata4Q8K3V1 295 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Unc45aQ99KD5 944 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 AdprmQ99KS6 340 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 TMEM121BQ99MX7 572 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Sytl2Q99N50 950 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Cxxc1Q9CWW7 660 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Dcaf6Q9DC22 876 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Egfl6Q9JJZ5 550 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 NbnQ9R207 751 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Insl5Q9WUG6 135 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Vstm4T1NXB5 319 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Znf106O88466 1888 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Nhsl2B1AXH1 854 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Tgfbr3lD3YZZ2 297 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Xirp1O70373 1129 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 IvlP48997 467 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Nr2c2P49117 596 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Sesn2P58043 480 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Perm1Q149B8 807 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Slc5a10Q5SWY8 596 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Serpinb6Q60854 378 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Adat2Q6P6J0 191 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Mgat5bQ765H6 792 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Noc4lQ8BHY2 516 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Tmem87aQ8BXN9 555 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ldlrap1Q8C142 308 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 AA792892Q8C6S1 278 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Zc2hc1cQ8CCG1 527 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Commd10Q8JZY2 202 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Atat1Q8K341 421 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Pcdhb17Q91VD8 799 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ppp1r16aQ923M0 524 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 NonoQ99K48 473 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Dpp3Q99KK7 738 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 PigxQ99LV7 254 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Q9CQC3 228 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 4930578G10RikQ9D4Q4 153 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ush1cQ9ES64 910 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 M1apQ9Z0E1 529 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Elf4Q9Z2U4 655 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Kcna10B2RQA1 511 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 MndalD0QMC3 538 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 D3Z070 196 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Gm3127E9Q9P5 263 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Gm3453K7N724 263 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Gucy1b3O54865 620 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Tspyl1O88852 379 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Fcgr2P08101 330 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Mcpt2P15119 244 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Tead2P48301 445 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Polr2fP61219 127 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Agap2Q3UHD9 1186 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Dzip1lQ499E4 774 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Myo6Q64331 1265 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Txndc8Q69AB2 127 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Gpr17Q6NS65 339 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Bola2Q8BGS2 86 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Psmd5Q8BJY1 504 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Hook3Q8BUK6 718 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 IntS13Q8QZV7 732 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.2 ms