RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 ATP11AP98196 1134 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CAPSQ13938 189 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 POF1BQ8WVV4 589 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 GIPC2Q8TF65 315 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PNMA5Q96PV4 448 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CDH19Q9H159 772 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 KLHL3Q9UH77 587 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TLDC2A0PJX2 215 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC189A1A4V9 331 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 KIAA0355O15063 1070 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CYP26A1O43174 497 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 ARIH2O95376 493 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 OR1E1P30953 314 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 ARL2P36404 184 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 CCL14Q16627 93 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 HYIQ5T013 277 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 TMEM253P0C7T8 217 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MAGEA11P43364 429 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 CCDC157Q569K6 752 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 SUSD3Q96L08 255 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CLPBQ9H078 707 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SENP1Q9P0U3 644 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ESPNB1AK53 854 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 CASP14P31944 242 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PASD1Q8IV76 773 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 HASPINQ8TF76 798 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ATL1Q8WXF7 558 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 RAPGEF5Q92565 580 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MTMR8Q96EF0 704 aa6.49□□□□□ -1.37
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