RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556355.5

SRP54-AS1-203, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 603 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CCNIQ14094 377 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CYP2A13Q16696 494 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CERCAMQ5T4B2 595 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RINT1Q6NUQ1 792 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NFRKBQ6P4R8 1299 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 Q6ZNX1 250 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HERC6Q8IVU3 1022 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NME8Q8N427 588 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 EPS8L2Q9H6S3 715 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UBN1Q9NPG3 1134 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FEM1BQ9UK73 627 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NFU1Q9UMS0 254 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.01□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 B9A039 149 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 F5H697 171 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 hCG_1984214I3L0E3 225 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PCDH17O14917 1159 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TRIAP1O43715 76 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TK1P04183 234 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 AKT1P31749 480 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NDUFV1P49821 464 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PNLIPRP1P54315 467 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 EIF5P55010 431 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MPP1Q00013 466 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UBE3AQ05086 875 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FPGSQ05932 587 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MAPK7Q13164 816 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC12A1Q13621 1099 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RPS6KA2Q15349 733 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMTC1Q8IUR5 882 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM57Q8N5G2 664 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HERVK_113Q902F9 699 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CPT1BQ92523 772 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GOLGA1Q92805 767 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C3orf49Q96BT1 292 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LRIG1Q96JA1 1093 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 COG8Q96MW5 612 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DUSP26Q9BV47 211 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SMOC2Q9H3U7 446 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 JMJD4Q9H9V9 463 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NOD2Q9HC29 1040 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 VPS45Q9NRW7 570 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SMC4Q9NTJ3 1288 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GGA3Q9NZ52 723 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HSFX1Q9UBD0 423 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LPAR3Q9UBY5 353 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 USP22Q9UPT9 525 aa5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 A6NLC8 198 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 H0Y3Z8 333 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 J3KTA2 159 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PRAMEF10O60809 474 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SUN1O94901 812 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM163BP0C2L3 166 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ARP10275 920 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RXRAP19793 462 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LMO1P25800 156 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 EPHA3P29320 983 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CD6P30203 668 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MCM2P49736 904 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GATMP50440 423 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PDE6CP51160 858 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PGDP52209 483 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DYRK1AQ13627 763 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CSHL1Q14406 222 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PTCHD3Q3KNS1 767 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ICE2Q659A1 982 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR1N1Q8NGS0 311 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NELL1Q92832 810 aa4.99□□□□□ -1.61
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RILPL2Q969X0 211 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms