RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520746.1

HDAC2-208, Transcript of histone deacetylase 2, human

TSL 3

Gene HDAC2, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC2-208	ENST00000520746	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	TOM1	O60784	492 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	PIAS2	O75928	621 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	INMT	O95050	263 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	CSF1R	P07333	972 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	SERPINB3	P29508	390 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	RABEP1	Q15276	862 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	NPY5R	Q15761	445 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	GGT6	Q6P531	493 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746		A0A1W2PPC4	97 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746		H0YIZ8	118 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	AREL1	O15033	823 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	TLR5	O60602	858 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	PEX14	O75381	377 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	NXPH3	O95157	252 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	A1BG	P04217	495 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	STK3	Q13188	491 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	GLG1	Q92896	1179 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	PRX	Q9BXM0	1461 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	FGF18	O76093	207 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	MYL4	P12829	197 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ABCB4	P21439	1286 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	HSPA1L	P34931	641 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	CLCN2	P51788	898 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	LINC00205	P59089	165 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	BTK	Q06187	659 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	BIRC2	Q13490	618 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	CCNI	Q14094	377 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.34	□□□□□ -1.71
HDAC2-208	ENST00000520746	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71

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