RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	GPD1	P21695	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	DIO1	P49895	249 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	LMAN2	Q12907	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	MTAP	Q13126	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ACOX1	Q15067	660 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	P3H1	Q32P28	736 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ZACN	Q401N2	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM38	O00635	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	PCDH17	O14917	1159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ADRA1D	P25100	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	CHKA	P35790	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	BFSP2	Q13515	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	REPS1	Q96D71	796 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	PSMD1	Q99460	953 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	DNPH1	O43598	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	NBN	O60934	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TCEA3	O75764	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	NTSR2	O95665	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	GLP2R	O95838	553 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	NPPB	P16860	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	KLRK1	P26718	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	SOX10	P56693	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	BLMH	Q13867	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	GRM4	Q14833	912 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	SYT5	O00445	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ACKR2	O00590	384 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	FCHO1	O14526	889 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TAF5L	O75529	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	C1QL1	O75973	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	JTB	O76095	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ANXA6	P08133	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	GYS1	P13807	737 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	AKT1	P31749	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	GSTM5	P46439	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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