RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364072.1

RNU6-501P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 501, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-501P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-501P-201ENST00000364072 RITA1Q96K30 269 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 TM7SF3Q9NS93 570 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 CEP83Q9Y592 693 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 CGB1A6NKQ9 187 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 BTBD19C9JJ37 291 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 ADAMTS3O15072 1205 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 DHHO43323 396 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 CA12O43570 354 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 GPC5P78333 572 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 CFHR3Q02985 330 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 KCNJ12Q14500 433 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 RAB30Q15771 203 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 FAM187BQ17R55 369 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 COLEC12Q5KU26 742 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 GALNT4Q8N4A0 578 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 ACRBPQ8NEB7 543 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC52A1Q9NWF4 448 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 CDC23Q9UJX2 597 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 DTNAQ9Y4J8 743 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRRT4C9JH25 899 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 H3BNC9 293 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRAMEF2O60811 474 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 DGKQP52824 942 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 FOXF2Q12947 444 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 DNASE1L3Q13609 305 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCDC142Q17RM4 750 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 TLDC1Q6P9B6 456 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 P3H2Q8IVL5 708 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 GRAMD1AQ96CP6 724 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM41AQ96HV5 264 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 ASB2Q96Q27 587 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 USP29Q9HBJ7 922 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 ARFGAP3Q9NP61 516 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 VPS45Q9NRW7 570 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 FZD4Q9ULV1 537 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 CA14Q9ULX7 337 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-501P-201ENST00000364072 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 UBE2Q2LH0YL09 131 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 PCDH17O14917 1159 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 GCATO75600 419 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 USP1O94782 785 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 VIPP01282 170 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 SETSIPP0DME0 302 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 DRD1P21728 446 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 TECP42680 631 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 BRD3Q15059 726 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 C4orf46Q504U0 113 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM196Q5HYL7 178 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM65Q6PI78 240 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 SKAP1Q86WV1 359 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 C8orf58Q8NAV2 365 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 DDB2Q92466 427 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 MUL1Q969V5 352 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCDC17Q96LX7 622 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 PIP5K1BO14986 540 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 GLP2RO95838 553 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 SRGAP2BP0DMP2 458 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms